Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chrac1Q9JKP8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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