Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms