Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms