Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp37Q8C0R0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp37Q8C0R0 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms