Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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