Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms