Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PhkbQ7TSH2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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