Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms