Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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