Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms