Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Traf3ip1Q149C2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms