Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ttc39dQ0VF76 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms