Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms