Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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