Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Sema6cQ9WTM3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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