Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms