Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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