Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms