Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hecw1Q8K4P8 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms