Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms