Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms