Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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