Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms