Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms