Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gja5Q01231 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms