Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Irx1P81068 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms