Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

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Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrig1P70193 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms