Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms