Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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