Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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