Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms