Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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