Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc1a6O35544 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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