Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vmn1r34G3XA52 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms