Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms