Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms