Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb1Q9CPU1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb1Q9CPU1 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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