Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc88cQ6VGS5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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