Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms