Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms