Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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