Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Gm5460Q3UQ97 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Gm5460Q3UQ97 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5460Q3UQ97 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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