Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms