Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms