Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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