Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ClgnP52194 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ClgnP52194 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms