Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Apoc1P34928 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms