Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms