Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RxrgP28705 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms