Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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